Утицај растварача на растворљивост пептида
На растворљивост пептида утиче њихов састав аминокиселина. Хидрофобне аминокиселине као што су леуцин (Леу), изолеуцин (Иле) и валин (Вал) чине пептиде хидрофобним, док хидрофилне аминокиселине као што су лизин (Лис), хистидин (Хис), аргинин (Арг) чине пептиде хидрофилним. Дакле, различити пептиди имају различиту растворљивост због разлика у саставу.
Утицај растварача на стабилност пептида
Реакција деамидације
У реакцији деамидације, хидролизом остатака аспарагина (Асн) и глутамина (Глн) формирају се аспарагинска киселина (Асп) и глутаминска киселина (Глу). Ове реакције могу утицати на стабилност пептида.
Оксидација
Раствори пептида су склони оксидацији, што може бити последица контаминације пероксидом у раствору или спонтане оксидације самог пептида. Оксидација не утиче само на структуру пептида, већ може довести и до њиховог губитка функције.
Хидролиза
Пептидне везе у пептидима се лако хидролизују и разбијају, посебно оне које формира Асп.
Грешка у формирању дисулфидне везе
Размена између дисулфидних веза или између дисулфидних веза и тиолних група може довести до формирања погрешних дисулфидних веза, што доводи до промена у терцијарној структури и губитка активности.
Рацемска реакција
Осим глицина (Гли), алфа атоми угљеника свих аминокиселинских остатака су хирални и склони реакцијама рацемизације под алкалном катализом. Међу њима, остаци аспарагинске киселине (Асп) су најсклонији реакцијама рацемизације.
- елиминација
- елиминација се односи на елиминацију функционалних група на атому угљеника у аминокиселинским остацима. Ова реакција је већа вероватноћа да ће се десити при алкалном пХ, а температура и јони метала такође имају утицај на њу.
Растворите пептиде у еколошки прихватљивим растварачима
Приликом растварања пептида, мала количина Н-метилпиролидона (ДМФ) или диметил сулфоксида (ДМСО) се може користити да помогне у растварању. Ова два растварача могу подстаћи растварање нарушавањем секундарне структуре пептида. Међутим, треба напоменути да ови растварачи могу ометати биолошку активност пептида и каснији истраживачки рад, тако да треба бити опрезан при њиховој употреби.
Закључак
Укратко, еколошки прихватљиви растварачи као што су ДМФ и ДМСО могу помоћи у растварању пептида нарушавањем њихове секундарне структуре, али њихова употреба може имати утицај на структуру и биолошку активност пептида. Стога, приликом одабира и употребе еколошки прихватљивих растварача, неопходно је одмерити њихов утицај на структуру и растворљивост пептида како би се обезбедила стабилност и биолошка активност пептида.