Уобичајени проблеми и решења у процесу синтезе пептида укључују следеће аспекте:
Садржај пептида: Садржај пептида се односи на проценат пептидних супстанци у узорку у односу на непептидне супстанце. У пептидне производе, поред самог пептида, укључене су и компоненте које нису соли уведене током процеса производње, као што су вода, апсорбовани растварачи, координациони јони и соли.
Хемијска стабилност:
Реакција деамидације: Асн/Глн остаци се лако хидролизују да би се формирао Асп/Глу.
Хидролиза: Пептидне везе у пептидима се лако разбијају хидролизом, посебно оне настале учешћем Асп, посебно Асп Про и Асп Гли пептидне везе.
Реакција рацемизације: Сви остаци аминокиселина осим Гли имају хиралне алфа атоме угљеника и склони су реакцији рацемизације под алкалном катализом. Асп остаци су најсклонији реакцијама рацемизације.
- деградација елиминацијом: Цис, Сер, Тхр, Пхе, Тир и други остаци се могу разградити кроз - елиминацију, што је вероватније да ће се десити при алкалном пХ и на коју утичу температура и јони метала
Физичка стабилност:
Денатурација, адсорпција, агрегација или преципитација: Денатурација пептида је обично повезана са уништавањем терцијарних и секундарних структура. У денатурисаном стању, пептиди су склонији хемијским реакцијама и њихову активност је тешко опоравити. Интермедијер који настаје током процеса денатурације има ниску растворљивост и склон је агрегацији и таложењу
очување:
Најбољи услови складиштења: Пептиди се углавном чувају у облику праха осушеног замрзавањем, који је веома стабилан на -20 степени, посебно након сушења замрзавањем и чувају се у сушачи од -20 степени. Већина пептида може се чувати на овој температури неколико година без промене. Да би се смањио утицај влаге, замрзавањем сушени пептиди треба да се врате на собну температуру у сувим условима пре него што буду изложени ваздуху.
Паковање: Хесхенг Биотецхнологи препоручује мало паковање како би се избегли поновљени циклуси замрзавања-одмрзавања, смањио број отварања и затварања контејнера, чиме се смањују шансе за неправилно руковање или бактеријска контаминација и осигурава стабилност пептида
Испитивање чистоће:
Гаранција чистоће: Сви испоручени пептиди су достигли потребну чистоћу, а пептиди који не испуњавају стандард биће одбачени. Резултати ХПЛЦ и МС детекције могу потврдити чистоћу и молекуларну тежину пептида, док приказују главне нечистоће.
Друге методе детекције, као што су анализа амино киселина или елементарна анализа, могу потврдити састав аминокиселина пептида као додатно средство за потврду пептида
Технологија синтезе:
Синтеза пептида у чврстој фази: Синтеза пептида у чврстој фази не захтева пречишћавање међупроизвода, омогућавајући континуиране процесе синтезе и постављање темеља за аутоматизацију синтезе пептида. На основу Фмоц хемијске синтезе, циљни пептид је синтетизован ковалентним повезивањем карбоксилне групе Ц-терминалне амино киселине са нерастворљивом полимерном смолом, а затим почев од амино групе амино киселине
Горњи садржај резимира уобичајене проблеме и контрамере у синтези пептида, покривајући више аспеката као што су хемијска стабилност, физичка стабилност, услови складиштења, испитивање чистоће итд.