Прилагођена синтеза пептида има широк спектар примена у различитим областима, укључујући:
1. Биохемијска и биолошка истраживања: Синтетички пептиди могу послужити као важан алат у биохемијским и биолошким експериментима за проучавање функције протеина, ћелијске сигнализације и још много тога.
2. Фармакологија и молекуларна медицина: Прилагођени пептиди се могу користити за развој лекова, као потенцијални кандидати за лекове или за припрему модела болести.
3. Биотехнологија: У биотехнолошкој индустрији, прилагођени пептиди се обично користе за скрининг високе пропусности, припрему медијума за ћелијску културу и развој реагенаса за биолошке анализе.